Trideset godina poslije rata, u pojedinim kantonima i dalje postoji fenomen 'dvije škole pod jednim krovom'. Najviše ih ima u Srednjobosanskom kantonu, uprkos sudskim presudama koje ukazuju na diskriminaciju djece. Upućeni naglašavaju, podjele među mladima već su osjetne.
Nakon što se završi nastava po hrvatskom planu i programu, učenici Srednje škole u Busovači napuštaju školsku zgradu. Trideset minuta poslije, dolaze oni koji pohađaju Mješovitu srednju školu po bosanskom programu. Sistem ih godinama uči da nisu isti, razlika je etnička pripadnost. I dok direktor jedne škole, koji nije želio pred kamere, kaže da sa kolegom iz druge škole odlično sarađuje, učenici se gotovo i ne sreću. Vremenom su se navikli na osjećaj podjele, što je za pojedine mještane Busovače poražavajuće.
Dvije škole pod jednim krovom i dalje postoje u HNK. Najviše ih je ipak u SBK u Vitezu, Bugojnu, Fojnici, uprkos tome što je još 2003. godine Vijeće za implementaciju mira zatražilo da se ukine ovaj sistem. Zbog opstrukcija, tadašnji ministar obrazovanja ovog kantona, Nikola Lovrinović je smijenjen. Na njegovo mjesto dolazi Greta Kuna koja 2007. šokira izjavom da je sistem dobar kako se ne bi miješale kruške i jabuke.
Od zidova u ovakvim školama, veći su oni koje političari pokušavaju sazidati u glavama mladih, a koje čak ni presude do danas nisu mogle oboriti.
Posljednjom presudom Ustavnog suda iz 2021. godine, utvrđena je diskriminacija djece. Vrhovni sud FBiH obavezao je resorno kantonalno ministarstvo da u roku od 30 dana formira integrisane multikulturne škole. Trenutni ministar, Bojan Domić, napominje da se na tome još uvijek radi.
